宏基因组高通量测序原理

生工人线粒体基因组测序（多重扩增法），项目介绍：生工生物高通量测序部采用多重扩增技术，对人线粒体基因组进行扩增捕获，并进一步采用Illumina测序平台进行高通量测序。该技术方案可以快速扩增到几乎线粒体全长，并进行高深度测序，下游提供常规比对筛查突变等生物信息分析。客户提供样品类型：1.人来源DNA，浓度大于1ng/ul，总量大于20ng，以Qubit检测结果为准2.运输条件：冰袋运输。交付信息：1.测序原始数据交付实验报告2.测序原始数据3.突变分析结果。一台10xGenomics Chromium X仪器能够在单次运行中分析数百至数十万个细胞，让百万级的细胞研究变得常规。宏基因组高通量测序原理

微生物基因组重测序（有参）：目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。微生物基因组从头测序（无参）：对于不断分离培养微生物的客户来说，要确定一个菌株是否是新菌株或者新菌种，较快捷的办法就是，直接进行基因组测序。利用高通量测序技术，对这些基因组进行高深度测序，然后进行基因组组装，获得基因组的框架图或者精细图甚至是完成图。从而可以快速解析其基因组结构、基因功能、进化关系。微生物高通量测序高通量请寄送样本（尤其是细胞样本）之前鉴定样本所属物种。

对于细胞样品，送样量需达到 5 × 106（5乘10的6次方）数量级。富集后置于 2 ml Ep管中，用 1 ml TRIzol 重悬，注意取样后立即用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰中用保温箱寄送。强烈建议细胞样品先做细胞鉴定及支原体/衣原体污染之后，再送出来。对于血液样本，只接收未冻存过的抗凝血新鲜样本。抗凝剂不可使用肝素钠，可用EDTA或ACD抗凝剂，取血后以冰袋保存，切记不能使血液冻结，从取血之时开始计算，须在48小时之内送达生工上海总部高通量测序部。如果不能提供新鲜样本，则请提供从血液中提取的总RNA样本。备样要求详见B、RNA 样品。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来，逐步引进了Illumina，Life，PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室（通过了国家ISO认证）以及10PB级运算能力的服务器集群，能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时，生工高通量测序团队建设也在不断完善中，目前有50余专职员工，其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上，5年来，通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子。

RNA样品：1.请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上电泳胶图或者 Agilent Bioanalyzer 仪器检测数据等；2.对于普通转录组样品，请提供浓度≥100 ng/µl、总量≥2 µg 的总 RNA 样品，样品请去蛋白并进行 DNase处理；一般情况下，普通转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280为 2.0~2.2，Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥8；对于全长转录组测序样品（ISO-seq）,请提供浓度大于200 ng/ul，总量大于5 μg的总RNA样品。样品请去蛋白并进行 DNase 处理；全长转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280 为 2.0~2.2，2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥8.5；小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒。生工生物 高通量测序NGS

生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验，日均处理样品200余例。宏基因组高通量测序原理

KBSeq全质粒测序跟一代测序相比有什么优点呢？一代测序：1.数据质量，套峰，双峰等情况，需要人工分析校对。2.测序长度，1 kb。3.成本，低。4.样本用量，100 ng。5.精确度，70-90%。6.测序能力，需要测序引物，只能测测序引物间的片段序列。7.通量低，（与读长有关）。8.实验周期，如果片段长度超过5K，测通可能需要15天左右。对于测序长度较长，如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间，而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天，就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。KBSeq全质粒测序对于样本的量，要求的也比较少，比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl，如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的，KBSeq就更为适合了。宏基因组高通量测序原理

生工生物工程（上海）股份有限公司在同行业领域中，一直处在一个不断锐意进取，不断制造创新的市场高度，多年以来致力于发展富有创新价值理念的产品标准，在上海市等地区的医药健康中始终保持良好的商业口碑，成绩让我们喜悦，但不会让我们止步，残酷的市场磨炼了我们坚强不屈的意志，和谐温馨的工作环境，富有营养的公司土壤滋养着我们不断开拓创新，勇于进取的无限潜力，生工生物工程供应携手大家一起走向共同辉煌的未来，回首过去，我们不会因为取得了一点点成绩而沾沾自喜，相反的是面对竞争越来越激烈的市场氛围，我们更要明确自己的不足，做好迎接新挑战的准备，要不畏困难，激流勇进，以一个更崭新的精神面貌迎接大家，共同走向辉煌回来！